EKSPLORASI RHIZOBAKTERI INDIGENOUS TANAMAN CABAI RAWIT (Capsicum frustescens Linn.) DARI PERTANIAN SEMI ORGANIK DESA BATUR KABUPATEN SEMARANG SEBAGAI AGEN HAYATI PENGENDALI PERTUMBUHAN JAMUR Fusarium oxysporum f.sp capsici

*Prastya Muhammad Eka  -  Universitas Diponegoro, Indonesia
Agung Suprihadi  -  Universitas Diponegoro, Indonesia
Endang Kusdiyantini  -  Universitas Diponegoro, Indonesia

Citation Format:
Abstract
Rhizobakteri merupakan kelompok bakteri yang hidup di sekitar daerah perakaran tanaman. Jenis bakteri ini diketahui memiliki kemampuan untuk memacu pertumbuhan tanaman dengan memproduksi hormon pemacu tumbuh, serta mampu menghambat pertumbuhan patogen tanaman dengan mensintesis senyawa antibiotik atau enzim ekstraseluler. Tujuan penelitian ini adalah memperoleh dan mendeskripsikan secara morfologi, biokimia dan genetik isolat rhizobakteri dari lahan pertanian semi organik Desa Batur Kabupaten Semarang yang memiliki kemampuan sebagai agen hayati pengendali pertumbuhan patogen jamur Fusarium oxysporum f.sp capsici. Hasil isolasi diperoleh lima belas isolat rhizobakteri yang mayoritas berbentuk bacilus dan tergolong gram positif. Kemampuan uji penghambatan rhizobakteri terhadap jamur patogen dilakukan menggunakan uji kultur ganda dan uji biomassa. Hasil uji kultur ganda menunjukkan bahwa isolat E1 memiliki daya hambat 3,77%, isolat E3 1,88% dan isolat E15 22%. Uji biomassa menunjukkan isolat E15 mampu menghambat pertumbuhan jamur patogen terbaik dengan berat biomassa jamur terkecil yakni 0,0386 gram. Hasil karakterisasi molekuler berdasarkan sekuen gen 16S rRNA diketahui isolat E15 identik dengan spesies Bacillus cereus strain ATCC 14579 dengan kemiripan sebesar 97%. Hasil karakterisasi biokimia isolat E15 memiliki kemiripan dengan spesies B. cereus yakni katalase positif, motil, memiliki endospora, mampu menghidrolisis pati dan memfermentasikan glukosa.
Fulltext View|Download
Article Info
Section: Articles
Language : ID
Recent articles
POTENSI RHIZOBAKTERI DARI TANAMAN KUBIS (Brassica oleracea var. capitata L.) DAERAH GETASAN SEMARANG SEBAGAI AGEN BIOBAKTERISIDA TERHADAP PATOGEN Xanthomonas campestris Deteksi Gen tlh dan tdh pada Bakteri Vibrio parahaemolyticus dari Air Tambak Udang Vanname (Litopenaeus vannamei) di Kabupaten Rembang Cloning of A Gene Encoding Protease from Bacillus halodurans CM1 into Escherichia coli DH5α More recent articles
  1. Anjaiah V, Koedam N, Nawak-Thompson B, Loper JE, Höfte M, Tambong JT, Cornelis P. 1998. Involvement of phenazines and anthranilate in the antagonism of Pseudomonas aeruginosa PNA1 and Tn5 derivatives toward Fusarium spp and Pythium spp. Mol Plant Microbe Interact 11: 847-854
  2. A’yun K Q, T Hadiastono, M Martosudiro. 2013. PengaruhpenggunaanPGPR
  3. (Plant Growth Promoting (Rhizobacteria) terhadap intensitasTMV (Tobacco
  4. Mosaic Virus), pertumbuhan, dan produksi pada tanaman cabai rawit (Capsicum frutescens L.). Jurnal HPT 1 (1): 47-56
  5. Bai, Y., X. Zhou, and D.L. Smith. 2003. Enchanced Soybean Plant Growth Resulting from Coinoculation of Bacillus sp. Strains with Bradyrhizobium japonicum. Crop Sci 43 : 1774-1781
  6. Bakker P.A.H.M dan Van Loon, L.C.. 2003. Signalling in Rhizobacteria- Plant interactions. In: De Kroon H, Visser EJW (eds) Root ecology. Ecological Studies, 168: 297–330
  7. Buchanan ER, Gibbon NE. 1974. Bergeys Manual of Determinative Bacteriology. Baltimore : Williams and Welkins Co. Chakraborty U, B Chakraborty, M Basnet. 2006. Plant growth promotion and induction of resistance in Cameliasinensis by Bacillus megaterium. Journal. Basic Microbiology. 46 (3): 186-195
  8. Compant, S., B. Duffy, J. Nowak, C. Cle’Ment, dan E. D. A. Barka. 2005. Use of Plant Growth- Promoting Bacteria for Biocontrol of Plant Diseases: Principles,
  9. Mechanisms of Action, and Future Prospects. Journal Applied and
  10. EnvironmentalMicrobiology 72(9): 4951 4959
  11. Dharmayanti I. 2011. Filogenetika Molekular : Metode Taksonomi Organisme Berdasarkan Sejarah Evolusi. Makalah. Balai Besar Penelitian Veteriner. Bogor
  12. Dikin A, Sijam K, Kadir J, Seman IA. 2006. Antagonistic bacteria against Schizophyllum commune FR. in Peninsular Malaysia. Biotropia 13:111-121
  13. Drancourt M, Bollet C, Carlioz A, Martelin R, Gayral JP, Raoult D. 2000. 16S ribosomal DNA sequence analysis of a large collection of environmental and
  14. clinical unidentifiable bacterial isolates. J Clin Microbiol 38: 3623- 3630
  15. Fakamizo, T., Honda, Y., Toyoda, H., Ouchi, S. & Goto, S.1996. Chitinous component of cell wall of Fusariumoxysporum, its structure deduced from chitosanase digestion..Biosci Biotech Biochem 60: 1705-1708
  16. Fernando, D., Nakkeeran, and Z. Yilan. 2005. Biosynthesis of Antibiotics by PGPR and Its Relation in Biocontrol of Plant Diseases dalam: Z.A. Siddiqui (ed.),PGPR:
  17. Biocontrol and Biofertilization. Springer. 67-109
  18. Hadioetomo, R. S. 1985. Mikrobiologi Dasar dalam Praktek : Teknik dan
  19. Prosedur Dasar Laboratorium. Gramedia, Jakarta
  20. Huang CJ, Wang TK, Chung SC, Chen CY.2005. Identification of an antifungalchitinase from a potential biocontrolagent, Bacillus cereus 28.9. J Biochem Mol Biol 38: 82-88
  21. Janda, J.M.,and Abbott, S.L. 2007. 16S rRNA Gene Sequencing for Bacterial Identification in the Diagnostic Laboratory: Pluses,Perils and Pitfalls. J.Clin Microbiol ; 45(9): 2761-2764
  22. Lim HS, Kim YS, Kim SD. 1991. Pseudomonas stutzeri YPL-1 Genetic Transformation and Antifungal Fusarium solani, an Agent of Plant Root Rot. Appl Environ Microbiol 57: 510-516
  23. Lee, Y. K., Jung, H.J., and Lee, H.K. 2006. Marine Bacteria Associated with the Korean Brown Alga, Undaria pinnatifida. The Journal of Microbiology.Vol:44,No.6;694- 698
  24. Long Richard A., Azam F. 2001. Microscale Patchiness Bacterioplankton of
  25. Assemblage Richness in Seawater. Journal Aquatic microbial Ecology. Vol
  26. : 103-113
  27. Madigan MT, Martinko JK, Parker JW. 2000. Brock Microorganism. Prentice Hall Inc
  28. Mayrowani H. Biology of New Jersey. 2012. Pengembangan pertanian organik di Indonesia. For.Penelitian Agro Eko. 30 (2): 91-108
  29. Rai, M. K. 2006. Handbook ofMicrobial Biofertilizer. Food Production Press. New York
  30. Rostini, N. 2011. 6Jurus Bertanam Cabai Bebas Hama dan Penyakit. AgroMedia Pustaka, Jakarta
  31. Susilowati, A. 2011.Karakterisasi Fisiologi dan Genetik Pseudomonas sp. sebagai Biokontrol Penyakit Cendawan Tular Tanah pada Tanaman Kedelai. Sekolah Pascasarjana Disertasi. Institut Pertanian Bogor, Bogor
  32. Tamura K, Dudley J, Nei M, Kumar S. 2007. MEGA4: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0. Molecular Biology and Evolution 10.1093/molbev/msm092. Walsh, P.S., D.A. Metzger, and R
  33. Higuchi. 1991. Chelex 100 as a medium for simple extraction of DNA for PCR-based typing from forensic material. Journal Biology Techniques 10:506-513
  34. Widodo. 2000. Studies on the Biological Control of Fusarium Basal Rot of
  35. Onion Caused by fusarium oxysporum f.sp. cepae.Disertation. Japan: Hokkaido Sapporo,Graduated Agrcultural, 186 p. University School of
  36. Winarsih, S. 2007. Pengaruh Bahan organik pada pertumbuhan Gliocladium virens dan daya antagonisnya terhadap Fusarium oxysporum secara In-Vitro. Jurnal Ilmu-ilmu pertanian 3:386-390. Indonesia
  37. Woese CR. 2006. How we do, dont and should look at bacteria and bacteriologi. In Prokaryotes (3th) Volume 1. Martin Dworkin (editor- in-chief). Science and Business Media Inc. Singapore, Springer, pp. 1-23
  38. Yuwono T. 2006. Biologi Molekuler. Erlangga .Jakarta

Last update:

No citation recorded.

Last update:

No citation recorded.