DOI: https://doi.org/10.14710/genres.v4i2.24380

Studi Penambatan Molekul dan HKSA Senyawa Turunan N-Fenil-N-Fenilasetil Thiourea dengan Substituen Halogen sebagai Inhibitor VEGFR2

*Wimzy Rizqy Prabhata orcid scopus publons  -  Department of Pharmacy, Faculty of Medicine, Universitas Diponegoro, Indonesia
Chaira Nisaa Mardhiyah  -  Department of Pharmacy, Faculty of Medicine, Universitas Diponegoro, Indonesia
Khairul Anam orcid scopus publons  -  Department of Pharmacy, Faculty of Medicine, Universitas Diponegoro, Indonesia
Received: 9 Sep 2024; Revised: 23 Sep 2024; Accepted: 25 Sep 2024; Available online: 1 Oct 2024; Published: 30 Sep 2024.
Open Access Copyright 2024 Generics: Journal of Research in Pharmacy

Creative Commons License
This work is licensed under a Creative Commons Attribution-ShareAlike 4.0 International License.

Citation Format:
Abstract

Vascular Endothrial Growth Factor Receptor-2 (VEGFR2) merupakan target terapi kanker yang berperan penting dalam proses angiogenesis dan pertumbuhan tumor. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui potensi senyawa turunan N-Fenil-N-Fenilasetil Thiourea dengan substituen halogen sebagai agen antikanker melalui penghambatan VEGFR2 secara in silico. Sebanyak 17 senyawa turunan halogen dari N-Fenil-N-Fenilasetil Thiourea dibuat ke dalam 10 konformer dan ditambatkan ke dalam struktur reseptor target VEGFR 2 (PDEB ID: 2OH4) dengan menggunakan PLANTS. Selanjutnya hasil dari uji penambatan digunakan dalam analisis HKSA dengan menggunakan 7 deskriptor yang berbeda. Senyawa 5 (substituen F pada R1,R3 dan R5) memiliki aktivitas terbaik berdasarkan nilai penambatan sebesar -102,201. Hasil ini lebih tidak baik dibandingkan dengan senyawa kontrol (ligan natif GIG). Persamaan HKSA yang didapatkan adalah -Log Act = 0.01230 (± 0.0120) Log P + 0.0096 (± 0.0093) Log S - 0.0004 (±0.0009) Mr - 0.0015 (±0.0011) Refractivity + 0.0043 (±0.0031) HOMO + 0.0027 (± 0.0031) LUMO – 0.0085 (± 0.0084) qC1 + 0.0244 (± 0.0420) qC2 – 0.0173 (±0.0106) qC3 + 0.0336 (±0.0549) qC4 + 0.0414 (±0.0279)qC5 + 2.1492 (±0.0662). Senyawa turunan halogen dari N-Fenil-N-Fenilasetil Thiourea memiliki potensi antikanker yang lebih rendah dibandingkan dengan senyawa kontrol (ligan GIG) sehingga perlu dikembangkan lebih lanjut sebagai agen antikanker.

Fulltext View|Download
Keywords: VEGFR; Antikanker; N-Fenil-N-Fenilasetil Thiourea; In Silico
Funding: Fakultas Kedokteran Universitas Diponegoro

Article Metrics:

Article Info
Section: Articles
Language : ID
Recent articles
Hubungan Tingkat Pengetahuan dengan Rasionalitas Swamedikasi Batuk di Kecamatan Tirto Kabupaten Pekalongan Perbedaan Kejadian Medication Error Fase Prescribing pada Resep Manual dan e-Resep di Rumah Sakit Nasional Diponegoro Periode Oktober-November Tahun 2022 Formulasi Sediaan Spray Gel SMEDDS Ekstrak Etanol 96% Daun Jambu Biji (Psidium guajava L.) sebagai Antibakteri Terhadap Staphylococcus aureus More recent articles
  1. De Araujo, A.D. Et Al. (2022) ‘Tuning Electrostatic And Hydrophobic Surfaces Of Aromatic Rings To Enhance Membrane Association And Cell Uptake Of Peptides’, Angewandte Chemie International Edition, 61(29). Available At: https://Doi.Org/10.1002/Anie.202203995
  2. Siswandono (2020) Kimia Medisinal 1 Edisi 2. Surabaya: Airlangga University Press
  3. Gebi Dwiyanti, A.L.S.W. (2009) Kimia Organik 3. 1st Edn. Jakarta: Universitas Terbuka
  4. Guan, L. Et Al. (2019) ‘Admet-Score - A Comprehensive Scoring Function For Evaluation Of Chemical Drug-Likeness.’, Medchemcomm, 10(1), Pp. 148–157. Available At: https://Doi.Org/10.1039/C8md00472b
  5. Hagras, M., Saleh, Marwa A., Et Al. (2022) ‘1,3,4-Oxadiazole-Naphthalene Hybrids As Potential Vegfr-2 Inhibitors: Design, Synthesis, Antiproliferative Activity, Apoptotic Effect, And In Silico Studies’, Journal Of Enzyme Inhibition And Medicinal Chemistry, 37(1), Pp. 386–402. Available At: https://Doi.Org/10.1080/14756366.2021.2015342
  6. Hagras, M., Saleh, Marwa A, Et Al. (2022) ‘Potential Vegfr-2 Inhibitors : Design , Synthesis , Antiproliferative Activity , Apoptotic Effect , And In Silico Studies’, Journal Of Enzyme Inhibition And Medicinal Chemistry, 37(1), Pp. 386–402. Available At: https://Doi.Org/10.1080/14756366.2021.2015342
  7. Harjanto, J.P. Et Al. (2021) ‘Hubungan Antara Ekspresi Vascular Endothelial Growth Factor (Vegf) Dengan Karakteristik Klinikopatologi Osteosarkoma Di Rsup Sanglah Denpasar, Bali’, Intisari Sains Medis | Intisari Sains Medis, 12(1), Pp. 177–182. Available At: https://Doi.Org/10.15562/Ism.V12i1.887
  8. Imelda, I. (2020) ‘Rekayasa Struktur Akseptor Pada Zat Warna Organik Tipe D- Π -A Dengan Kerangka Tiofen’, Journal Of Research And Education Chemistry, 2(1), P. 30. Available At: https://Doi.Org/10.25299/Jrec.2020.Vol2(1).4857
  9. Kesuma, D. Et Al. (2018) ‘Uji In Silico Aktivitas Sitotoksik Dan Toksisitas Senyawa Turunan N-(Benzoil)-N’- Feniltiourea Sebagai Calon Obat Antikanker’, Jpscr : Journal Of Pharmaceutical Science And Clinical Research, 3(1), P. 1. Available At: https://Doi.Org/10.20961/Jpscr.V3i1.16266
  10. Kilo, J. La And Kilo, A. La (2019) ‘Kajian Hksa Antimalaria Senyawa Turunan Quinolon-4(1h)-Imines Menggunakan Metode Mlr-Ann’, Jambura Journal Of Chemistry, 1(1), Pp. 21–26. Available At: https://Doi.Org/10.34312/Jambchem.V1i1.2104
  12. Król, M., Pawłowski, K.M. And Majchrzak, K. (2010) ‘Why Chemotherapy Can Fail?’, Pp. 399–406. Available At: https://www.Researchgate.Net/Publication/45819342
  13. Masoumi Moghaddam, S. Et Al. (2012) ‘Significance Of Vascular Endothelial Growth Factor In Growth And Peritoneal Dissemination Of Ovarian Cancer’, Cancer And Metastasis Reviews, 31(1–2), Pp. 143–162. Available At: https://Doi.Org/10.1007/S10555-011-9337-5
  15. Megawati, D.S., Ekowati, J. And Siswandono, S. (2023) ‘Quantitative Structure-Activity Relationship (Qsar) Of N-Benzoyl-N’-Naphtylthiourea Derivative Compounds By In Silico As Anticancer Through Inhibition Of Vegfr2 Receptors’, In, Pp. 137–148. Available At: https://Doi.Org/10.2991/978-94-6463-148-7_15
  16. Meng, X.-Y. Et Al. (2011) ‘Molecular Docking: A Powerful Approach For Structure-Based Drug Discovery.’, Current Computer-Aided Drug Design, 7(2), Pp. 146–57. Available At: https://Doi.Org/10.2174/157340911795677602
  17. Mistry, B.M. Et Al. (2019) ‘Chrysin–Benzothiazole Conjugates As Antioxidant And Anticancer Agents’, Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters, 25(23), Pp. 5561–5565. Available At: https://Doi.Org/10.1016/J.Bmcl.2015.10.052
  18. Nabilla Cahyani, F. Et Al. (2021) ‘Pengembangan Dan Optimasi Kapsul Mikrosfer Ekstrak Licorice Sebagai Bentuk Sediaan Oral Extended Release Kanker Payudara’, Pharmaceutical Journal Of Indonesia, 7(1), Pp. 63–70. Available At: https://Doi.Org/10.21776/Ub.Pji.2021.007.01.10
  19. Nurhidayah, I., Widiasih, R. And Ermiati, E. (2022) ‘Analysis Of Ovarian Cancer Risk Factor : A Systematic Review’, Jurnal Pendidikan Keperawatan Indonesia, 8(1), Pp. 77–90. Available At: https://Doi.Org/10.17509/Jpki.V8i1.40835
  20. Prabhata, W.R., Aulannisa F., And Rahman, M.A.R.N. (2022) ‘¬¬¬Review Artikel: Strategi Pengembangan Senyawa Thiourea sebagai Agen Antikanker’, Generics: Journal of Research in Pharmacy, 2(2), pp. 128-139. Available at: https://doi.org/10.14710/genres.v2i2.15916
  21. Rahayuningsih, S.R., Mayanti, T. And Azzahra, F. (2023) ‘Efek Sitotoksisitas Dan Genotoksisitas Dari Fraksi-Fraksi Ekstrak Etanol Daun Rhizopora Stylosa Griff. Terhadap Pembelahan Sel Dan Kromosom Pada Akar Allium Cepa L.’, Journal Of Marine Research, 12(4), Pp. 701–716. Available At: https://Doi.Org/10.14710/Jmr.V12i4.41360
  22. Santoso, B. (2018) ‘Pengaruh Residu Fleksibel Terhadap Nilai Afinitas Ikatan Protein Dengan Ligan Native-Nya Menggunakan Pyrx-Vina’, In Conference: The 7th University Research Colloquium (Urecol). Available At: www.Rcsb.Org
  23. Santoso, B. (2019) ‘Hubungan Optimasi Molekul Dengan Afinitas Ikatan Docking Senyawa Terpilih Dalam Teripang’, In Conference:The 9th University Research Colloqium (Urecol). Available At: Https://www.Researchgate.Net/Publication/337244123
  24. Stefanska, J. Et Al. (2015) ‘Antimicrobial And Anti-Biofilm Activity Of Thiourea Derivatives Incorporating A 2-Aminothiazole Scaffold.’, Chemical & Pharmaceutical Bulletin, 63(3), Pp. 225–36. Available At: https://Doi.Org/10.1248/Cpb.C14-00837
  25. Verteramo, M.L. Et Al. (2024) ‘Interplay Of Halogen Bonding And Solvation In Protein–Ligand Binding’, Iscience, 27(4), P. 109636. Available At: https://Doi.Org/10.1016/J.Isci.2024.109636
  26. Who (2020) Total Cancer Cases In Indonesia (2020). Available At: https://Www.Who.Int/Publications/M/Item/Cancer-Idn-2020 (Accessed: 14 May 2023)
  27. Widiyanti, H., Banon, C. And Adfa, M. (2020) ‘Analisis Hubungan Kuantitatif Struktur Terhadap Aktivitas Turunan Senyawa Cubebin Sebagai Antikanker Dengan Metode Recife Model 1 (Rm1)’, Bencoolen Journal Of Pharmacy, 2021(1), Pp. 46–58

Last update:

No citation recorded.

Last update:

No citation recorded.