Isolasi dan Identifikasi Molekuler Bakteri Pelarut Fosfat dari Gua Gamelan di Kawasan karst Kiskendo Kendal, Jawa Tengah

*Hawari Rosdiana Mahmudah  -  Laboratorium Bioteknologi, Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Matematika, Universitas Diponegoro, Indonesia
Agung Suprihadi  -  Laboratorium Bioteknologi, Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Matematika, Universitas Diponegoro, Indonesia
Anto Budiharjo  -  Laboratorium Bioteknologi, Departemen Biologi, Fakultas Sains dan Matematika, Universitas Diponegoro, Indonesia

Citation Format:
Abstract

Bakteri pelarut fosfat (BPF) merupakan bakteri yang mampu melarutkan fosfat yang tidak tersedia menjadi tersedia sehingga dapat diserap oleh tanaman. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan isolasi dan identifikasi molekuler bakteri pelarut fosfat melalui identifikasi 16s rRNA dari guano gua gamelan dan kemampuannya dalam melarutkan fosfat. Kegiatan penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahap, yaitu isolasi BPF dalam medium pikovskaya dan NBRIP, pewarnaan gram, serta identifikasi molekuler. Hasil isolasi diperoleh dua isolat bakteri, yaitu G4-1 dan G5. Isolat G5 yang paling tinggi melarutkan fosfat dengan diameter zona bening sebesar 22.01 mm, dan isolat G4-1 memiliki diameter zona bening 19.8 mm. Isolat G4-1 dan G5 merupakan bakteri gram- negatif. Hasil amplifikasi DNA BPF menggunakan primer universal 27 F (5’-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG- 3’) dan Primer 1492 R (5’-GGTTACCTTGTTACGACTT-3’) menghasilkan produk PCR berukuran 1520 bp dan 1235 bp. Hasil analisis sekuen gen 16s rRNA menunjukan bahwa isolat G4-1 memiliki homologi sebesar 80% dengan Acinetobacter iwofii strain-JCM parsial sekuen, sedangkan isolat G5 memiliki homologi sebesar 92% dengan Serratia marcesens strain-NBRC

Fulltext View|Download
Article Info
Section: Articles
Language : ID
Recent articles
Identifikasi Jenis Pigmen dan Uji Potensi Antioksidan Ekstrak Pigmen Bakteri Serratia marcescens Hasil Isolasi dari Sedimen Sumber Air Panas Gedong Songo POTENSI RIZOBAKTERI PEMBENTUK ENDOSPORA DARI TANAMAN PADI SEBAGAI BIOKONTROL FITOPATOGEN Xanthomonas oryzae Uji Aktivitas Antibakteri Ekstrak Biji Kelor (Moringa oleifera L.) Terhadap Pertumbuhan Bakteri Staphylococcus aureus dan Bakteri Escherichia coli More recent articles
  1. Barrow, G.I. & R.K.A Feltham. 1993. Cowan and Steel Manual for the Identification of Medical Bacteria. New York : Cambridge University Press
  2. Clarridge JE. 2004. Impact of 16s rRNA gene sequence analysis for identification of bacterial on clinical microbiology and infectious diseases. ClinMicrobiol Rev 17:840-862
  3. Doughari, Hamuel J., Patrick Alois Ndakidemi.,Izanne Susan Human., Spinney Benade. 2011. The ecology, bilogy, and pathogenesis of Acinetobacter spp.: an overview, Microbes and Environtment, Applied Sciences Faculty, Cape Penisula University Of Technology, South Africa
  4. Ginting, R.C.B., R. Saraswati dan E. Husen. 2006. Mikroorganisme Pelarut Fosfat. Dalam Simanungkalit, R.D.M., Suriadikarta, D.A., Saraswati, R., Setyorim, D., dan Hartatik, W. Pupuk Organik dan Pupuk Hayati. Selected reading, hlm. 141-158. Balai Besar Litbang Sumber daya Lahan Pertanian. Bogor
  5. Illmer, P., Barbato, A., and Schinner, F. 1995. Solubilization of Hardly-Soluble AlPO4 with P-solubilizing Microorganisms. Soil Biol.Biochem. 27:265-270
  6. James, J., C. Baker, H. Swain. 2008. Prinsip- prinsip sains untuk keperawatan. Erlangga, Jakarta
  7. Janda, J.M. and S. L. Abbott. 2007. 16s rRNA gene sequencing for bacterial identifications in the diagnostic laboratories: Pluses, perils, and pitfalls. J. Clinic Microbiol. 45(9):2761-2761
  8. Lemey, P., M. Salemi & A.M. Vandamme. 2009. The Phylogenetic Handbook: A Practical Approach to Phylogenetic Analysis and Hypothesis Testing. Cambridge University Press. UK
  9. Mohan, M., G. Selvakumar, S.N. Sushil, J.C. 2011. Entomopathogeneticity of endophytic Serratia marcescens Strain SRM against larvae of Helicoverpaarmigera (Noctuidae: Lepidoptera). World J. Microbiol. Biotechnol. Published online 07 april 2011
  10. Musapa, M., T .Kumwenda, M. Mkulama, S. Chishimba, D. E. Noris, P. E. Thuma, dan S. Mharakurwa. 2013. A simple chelex protocol for DNA extraction from Anopheles spp. J. Vis. Exp. 71: 1- 7
  11. Osborne, C. A., M. Galic, P. Sangwan, dan P. H. Jansen. 2005. PCR generated artifact from 16S rRNA gene-specific primers. FEMS Microbiol. Lett. 248: 183-187
  12. Sambrook J, Fritsch EF, Maniatis T. 1989. Molecular cloning : a laboratory manual. Second Edition. CSH Centennial
  13. Setiawati, M. R. & Pranoto, E. 2015. Perbandingan Beberapa Bakteri Pelarut Fosfat Eksogen pada Tanah Andisol sebagai areal Pertanaman Teh Dominan di Indonesia. Jurnal Penelitian Teh dan Kina 8(2): 158-164
  14. Simanungkalit, R. D. M dan Suriadikarta, D. A. 2006. Pupuk Organik dan Pupuk Hayati. Balai Besar Litbang Sumberdaya Lahan Pertanian. Bogor. Situmorang, E. C., Prameswara, A. S. H. C., Mathius, N. T. & Liwan, T. 2015. Indigenous Phospate Solubilizing Bacteria from Peat Soil Solé, M.,
  15. Francia A., Rius, N., & Lorén, J. G. 1997. The Role of pH in The “Glucose Effect” on Prodigiosin Production by Non-proliferating Cells of Serratia marcescens. Lett Appl Microbiol. 25: 81–84
  16. SWOFFORD, D.L., G.J. OLSEN., P.J. WADDELL and D.M. HILLS. 1996
  17. Phylogenetic inference. In: Molecular Systematics, 2nd Edition. HILLS, D.M., C. MORITZ and B.K. MABLE
  18. (Eds.) Sinauer Associates, Sunderland, Massachusetts. Chap. 5 pp. 407 – 514
  19. Widawati S & Suliasih. 2006. Populasi Bakteri Pelarut P (BPF) di Cikini, Gunung Botol dan Ciptarasa serta Kemampuannya dalam melarutkan P Terikat di Media Pikovskaya Padat. Jurnal Biodiversitas. 7 (2) : 109 –113
  20. Widyati E. 2007. Formulasi inokulum Mikroba: MA, BPF dan Rhizobium Asal Lahan Bekas Tambang Batubara untuk Bibit Acacia crassicarpa Cunn. Ex-Benth. Jurnal Biodiversitas 8 (3) : 238 - 241
  21. Yukimasa N, Takeshi I, Hiroshi I. 1988. Acinetobacter radioresistens sp. nov. isolated from cotton and soil. Int J Syst Bacteriol. 38(2): 209-211

Last update:

No citation recorded.

Last update:

No citation recorded.